目前常用的無菌包裝形式有無菌紙板包裝、無菌杯式包裝、無菌大袋灌裝機、無菌鋁、塑袋包裝和無菌塑料瓶包裝等。
無菌大袋灌裝機是指包裝容量為5到220升大可達1000升的復合袋包裝。灌裝后的袋子裝在木質或紙板制成的外包裝箱中或鋼桶中,主要包裝濃漿或基料為5到20升的產品,也可直接供家庭消費。目前無菌大袋灌裝機這種包裝形式已基本取代了由鐵桶或塑料桶做外包裝,再在食品內加防腐劑保存食品的包裝方法。大袋包裝的材料結構有兩種形式:PET膜、鋁箔、PE膜或PET鍍鋁膜、PE膜采用干式復合的方法復合。由于鍍鋁膜易有氣孔,不能保證其阻隔性能,因此,我國一般都采用鋁箔做阻隔材料。
無菌鋁、塑包裝的包裝方法類似于無菌紙包裝,只不過使用的材料是鋁、塑復合膜。包裝形式是袋裝,所用的包裝膜多采用干式復合和流延復合的方式。
無菌瓶包裝采用共擠塑料瓶或單組分的PP和PE。塑料瓶可以在成型時滅菌,并立即灌裝也可以在灌裝前滅菌,滅菌的瓶子在無菌室中灌裝和壓蓋。
液體食品采用無菌包裝已成為上比較流行的趨勢。其中尤以鋁箔復合紙包裝較為普遍,原因是這種包裝形式能使被包裝之物保存于不透光、不透氣、無菌的理想環境中,在常溫下也能保持12個月以上,且品質不變。同時,其質量較輕也較適合長途運銷。